由于在十月电影公司制作的《狂恋大提琴》中饰演的Jackie扣人心弦，沃森获得1999年度演员工会奖和英国电影电视艺术学院奖最佳女演员提名。除此之外，她还获得奥斯卡和金球奖的二次提名。该片生动地刻画了著名古典大提琴演奏家杜普蕾（Jacqueline du Pre）悲剧的一生。
在电视片中，沃森在George Eliot原著改编的《弗洛斯河上的磨坊》中饰演Maggie Tulliver，该片由英国广播公司巨著剧院出品并大受好评。
作为伦敦戏剧的资深演员，沃森的成果包括《三姐妹》、《双姝怨》（在英国皇家国家剧院上演）和《The Lady from the Sea》。2002年春， Watson在多玛仓库剧院同时出演两部作品《万尼亚舅舅》（饰Sonya）和《第十二夜》（饰Viola）。这两部作品均由获奥斯卡奖的Sam Mendes导演执导（他曾导演过《美国丽人》和《毁灭之路》）。这几部颇具好评的作品仅在纽约布鲁克林音乐学院上演过几场。她还和皇家莎士比亚公司广泛合作，作品包括《驯悍记》、《家有喜事》和《夺魄冤魂》。2007年，沃森和丈夫共同编写的剧本Mood Indigo被Capitol Films选中。电影讲述的是一个设定在二战时期一位年轻姑娘和一位飞行员的爱情故事。
