1988年，马俊仁开始任辽宁田径队女子中长跑组教练，马家军成型。
1993年在德国斯图加特举行的第4届田径世锦赛上，马俊仁率领辽宁女子中长跑队席卷女子1500米以上项目三枚金牌，“马家军”的名号被叫响。年底，队中世界冠军刘东被驱逐出队，引起媒体对马俊仁家长作风的质疑。
1994年“马家军兵变”，包括王军霞在内的全体队员签名“上书”马俊仁，表示要退出辽宁中长跑队。
1996年，王军霞脱离马俊仁，在毛德镇教练手下训练，同年夺得亚特兰大奥运会5000米冠军。
1997年，马家军东山再起，第二梯队的姜波、董艳梅在八运会上双双打破女子5000米世界纪录，董艳梅等还包揽女子万米前三名。
1998年，作家赵瑜主笔的《马家军调查》出版，导致其与马俊仁打官司。
2000年，耗资4500万元的“马家军基地”建成。同年，队中尹丽丽和宋丽清被查出服用兴奋剂，遭到田管中心两年禁赛处罚，马家军无一人入选奥运阵容。
2001年，马家军中兰丽新血检超标，被马俊仁“永远开除”。九运会上马家军金牌再获丰收。
2002年，马家军台柱之一董艳梅出走。
2003年底，马俊仁出任中国首家藏獒俱乐部主席，全国政协委员。
2004年雅典奥运会经过全国选拔，马家军无一人入选。
2004年10月28日，马俊仁退休，马家军时代宣告彻底结束。
