1992年参与创建“轮回”乐队，担任乐队主唱。1993年，他把宋词《永遇乐·京口北固亭怀古》改编为《烽火扬州路》，将民乐与摇滚融合起来，影响了中国民族化摇滚，使轮回乐队为人所知。
1995年他所在的轮回乐队出版了第一张专辑《创造》，收录了《烽火扬州路》。1997年，乐队签约于日本JVC唱片公司,并于同年出版了专辑《心乐集》。
1999年，吴彤在美国密执安大学音乐学院举行中国民族管乐器讲座时结识了华裔大提琴家马友友，最后成为丝绸之路乐团的核心成员。 ]
2000年，带领轮回乐队参加中央电视台跨世纪元旦晚会，成为第一个登上中央电视台的摇滚乐队。 2001年吴彤参与了在纽约录制的专辑《When Strange Meeting》， 其中收录了由吴彤改编的两首作品《MiduMouten》和《Blue Littel Flower》。2002年乐队推出了一张翻唱专辑《我的太阳》及原创专辑《超越轮回》。
2004年，吴彤离开轮回乐队，之后创建了一支全部由中国演奏家组成的乐队“中国喜鹊”。同年，吴彤应邀在美国西门子公司研究电子笙的开发与应用，并运用这种方法创作了新作品《WalkingClouse》，得到了新泽西、纽约、香港、新加坡观众的肯定。
2006年吴彤签约香港大国文化，并且与港台音乐人共同进行制作个人专辑；单曲《记得》一经推出便在全国五十多家排行榜名列榜首。2007年担任CCTV民族器乐大赛评委。
2008年9月应旧金山歌剧院的邀请，参加歌剧《接骨师之女》的演出，得到了美国纽约时报等多家媒体的好评。11月应邀为电影导演王家卫的电影《东邪西毒》终极版重新配乐，得到王家卫导演的肯定，并称之为“音乐上的痞子”。
2010年担任CCTV青年歌手电视大奖赛流行组评委。2012再度担任CCTV民族器乐大赛评委。
2011年2月登上央视春节联欢晚会的舞台，与郑钧联唱新民乐组合歌曲《马铃响来玉鸟唱》与《赶圩归来阿里里》。 2011年7月，吴彤姚谦联袂为斯巴鲁森林人系列新车打造新广告推出主题曲《我行我路》。
2013年3月20日，受邀与香港管弦乐团在香港文化中心音乐厅参加为纪念张国荣先生逝世十周年专场音乐《光影流影张国荣》的演出。5月再度担任CCTV青年歌手电视大奖赛评委。11月携手大提琴家马友友及作曲家赵麟，首演协奏曲《度》。
2015年2月应邀为当代著名画家吴冠中的画作谱曲，并为吴冠中作品专题配乐及录制《生命的风景》专辑。
2015年12月31日和2016年1月1日，吴彤在北京天桥艺术中心连办两场“《世界和笙》”跨年专场演出——通过与中国笙、印度鼓、西班牙风笛的跨界合作，为观众带来前所未有的现场体验。
2016年6月受王家卫导演的邀请，出席第19届上海电影节，参加《东邪西毒》蓝色火焰音乐会的演出。 同月作为闭幕式唯一表演嘉宾出席世界经济论坛第十届新领军者年会暨2016天津夏季达沃斯论坛，献上多首跨界音乐作品。 7月受第十五届环青海湖国际公路自行车赛组委会的邀请，作为开幕式演出嘉宾压轴献唱歌曲《我行我路》。12月参与央视《记住乡愁》第三季开播晚会的录制，倾情献唱歌曲《故乡是北京》。
2017年1月再次登上央视春节联欢晚会的舞台，独唱歌曲《一片深情》。
2017年1月参加2017年华人华侨春晚，演唱歌曲《Going Home》(回家）。
2017年2月12日获格莱美奖，吴彤与丝路乐团成员共同登台接受奖杯。.
2017年4月，受导演张艺谋邀请，参与观念剧《对话·寓言 2047》第一季， 独立创作50%音乐并演出《笙·如影》一幕（共7幕）。
2017年 11月，美国亚洲协会以他“展示了卓越的，没有隔阂的音乐境界”，为他颁发 年度的“亚洲创变者奖”（Asia Game Awards)。
2018年跨年夜和新年元旦夜，在珠海举办新年音乐会。
2018年 参加北京卫视春晚，改编了丝路跨界风格的《茉莉花》，与迪玛希共同演唱。
2018年在《国家宝藏》第一季盛典上带来《将进酒》，并在第二季献上歌曲 《抱月入怀》。
2019年广东卫视和山西卫视担任国乐大典第二季冠军乐团寻乐人。
2019年6月，吴彤受邀参加世界达沃斯论坛，再次作为唯一的闭幕式表演嘉宾演讲和演出。
2019年，吴彤再次参与张艺谋导演的观 念剧《对话·寓言2047》，担任音乐总监。
2020年9月12日，以“特邀乐团前辈”的身份参与《明日之子乐团季》总决赛；12月31日，参加由央视频与哔哩哔哩联合推出的《2020最美的夜 bilibili晚会》。
2021年9月19日，在河南卫视《中秋奇妙游》中出演创意节目《和》。
2022年1月，参加2022山东春晚表演节目《“呐”些日子》，参加北京2022年冬奥会和冬残奥会颁奖仪式推广歌曲《致敬勇士》的演唱；2月1日，参加《2022丝路春晚》。
